A 43 éves kerekes pozitív doppingtesztet produkált a 2005-ös Vuelta a Espanán, amiért két évre eltiltották, továbbá megfosztották rekordot jelentő negyedik címétől.
A spanyol bíróság azonban 2011-ben a doppingellenőrzés során történt eljárási hibák miatt felülbírálta az ítéletet, ezt egy évvel később pedig a legfelsőbb bíróság helybenhagyta. Emiatt Heras kártérítési pert indított, melyben egymillió eurót követelt, végül hétfőn 725 ezer eurót ítéltek meg neki.
A legfelsőbb bíróság azzal indokolta a döntését, hogy Heras az ügy miatt elvesztette profi szerződését csapatánál, illetve szponzorációs megállapodásait is felmondták.
Heras 2000-ben, 2003-ban, 2004-ben és 2005-ben nyerte meg hazája háromhetes körversenyét, további két alkalommal pedig dobogós volt. A Tour de France-on az ötödik hely volt a legjobbja 2000-ben.