A költségvetés beterjesztésekor derült ki az MTA elnökségének, hogy a kutatóintézetek költségvetését az újonnan felállított Innovációs Minisztérium alá rendeli a költségvetés. Így a Magyar Tudományos Akadémia kiterjedt kutatóintézet hálózatának finanszírozásának nagy része, 20 milliárd forint átkerült a Palkovics László vezette Innovációs és Technológiai Minisztériumhoz.
Berenner Koloman szerint a kutatásokra nagyságrendekkel több pénzt kellene költeni, az pedig, hogy erről a Magyar Tudományos Akadémia vezetősége csak a sajtóból értesült, a ”Fidesz kormány eddigi hatalomgyakorlási tendenciáit nézve rendkívül aggasztó.”